Os ácidos nucléicos são digeridos no intestino, mais especificamente no duodeno, onde desembocam os ductos que trazem a bile do fígado e o suco pancreático do pâncreas. Neste, estão contidas as nucleases, que quebram os ácidos nucléicos em nucleotídeos, depois em bases nitrogenadas e monossacarídeos. Essas bases são absorvidas por transporte ativo, e os monossacarídeos por difusão facilitada e transporte ativo secundário, como outros açúcares simples.